Umeå universitet är ett av Sveriges största lärosäten med över 37 000 studenter och cirka 4 700 anställda. Vid universitetet finns en mångfald av utbildningar av hög kvalitet och världsledande forskning inom flera vetenskapsområden, och här gjordes den banbrytande upptäckten av gensaxen CRISPR-Cas9 som tilldelats Nobelpriset i kemi. Vid Umeå universitet är allt nära. Våra sammanhållna campus gör det lätt att mötas, samarbeta och utbyta kunskap, något som gynnar en dynamisk och öppen kultur.
Den samhällsomvandling och de stora gröna investeringar vi ser i norra Sverige skapar enorma möjligheter och komplexa utmaningar. För Umeå universitet handlar det om att bedriva forskning om – och mitt i – ett samhälle i omvandling. Men också om att leverera utbildningar för regioner som behöver expandera fort och hållbart. Det är helt enkelt här framtiden skapas.
Är du intresserad av att veta mer? https://www.umu.se/jobba-hos-oss/om-universitetet-som-arbetsplats/
Medicinska fakulteten är en av de största fakulteterna vid Umeå universitet och attraherar många studenter med ett omfattande utbud av utbildningar inom områdena medicin, tandvård, hälsa och vård. Vi erbjuder en väl utvecklad forskningsinfrastruktur och en inspirerande, dynamisk miljö med ledande forskning. Vår nära samverkan med de fyra regionerna i Norra sjukvårdsregionen ser vi som en stor ömsesidig tillgång för att utveckla forskning och utbildning och att säkra tillgången på vår framtids vårdpersonal.
Beskrivning
Inom ramen för projektet kommer vi att använda single-cell-sekvenseringsmetoder, bioinformatik och genomredigering, samt co-kultursystem för att modellera interaktioner mellan neuroner och gliomceller; med huvudfokus på att studera inverkan av neuronaktivitet i 3D-genomorganisation och cellulär plasticitet vid glioblastom.
Med detta projekt kommer vi att fortsätta våra banbrytande studiet av genregulatoriska nätverk underliggande neurogliomala synapser.
Experimentell metodik inkluderar single-cell-sekvensering (scRNA-seq och scATAC-seq), tekniker för att definiera 3D genomorganisation (HiChIP, HiC, Capture-C) och bioinformatik. Den sökande ska kunna: 1) självständigt planera experiment, 2) bedriva forskning inom ramen för gruppens forskningsprogram, 3) etablera metoder, 4) analysera forskningsresultat, 5) kommunicera resultat och presentera data vid nationella och internationella vetenskapliga möten.
Arbetsuppgifter
Arbetsuppgifterna innefattar cellodling av glioblastomceller från patienter samt iPSC-derived neuroner, astrocyter och OPCs. Dessa används för att studera hur neuronal aktivitet och andra yttre signaler påverkar 3D-genomorganisationen, kromatinlandskapet och glioblastomcellers plasticitet med hjälp av multi-omikmetoder. De använda omik-teknikerna inkluderar HiC, HiChIP, ATAC-seq, CUT&RUN, ChIP-seq och RNA-seq, samt singelcell-sekvenseringsmetoder. Arbetet innefattar även bioinformatisk analys av all genererade data med hjälp av ett brett utbud av komputationela verktyg.
Kvalifikationer
För att vara behörig ska du ha doktorsexamen inom biomedicin, molekylärbiologi eller ett närliggande ämnesområde samt erfarenhet som postdoktoral forskare. En stark bakgrund inom genomik, epigenomik och bioinformatik krävs.
Erfarenhet av cellodling av humana cancercellinjer, iPSC/progenitorer samt neuroner och gliaceller är ett krav. Erfarenhet av följande tekniker är nödvändig: HiC, HiChIP, ATAC-seq, CUT&RUN, ChIP-seq och RNA-seq. Dokumenterad erfarenhet av bioinformatiska metoder krävs.
Kunskap i att skriva och köra shell-skript samt arbete på beräkningskluster såsom UPPMAX eller HPC2N är nödvändig. Erfarenhet av analys av RNA-seq-data (STAR, HISAT, DESeq2, DEXSeq); ChIP-seq-, CUT&RUN- och ATAC-seq-data (Bowtie, MACS, SEACR, MEME, IDRtools); HiC- och HiChIP-data (HiC- och HiC-Pro-pipeline, Juicer, TopDom, HiCCUPS, FitHiC, HiCPlotter, GENOVA); samt scATAC- och scRNA-seq-data (Seurat, Scanpy, STARSolo, cellRanger) är ett krav. Erfarenhet av Python- och R-verktyg krävs.
Meriterande
Bakgrund inom neurovetenskap och/eller glioblastom är meriterande. Publikationer inom genreglering, 3D-kromatinorganisation och/eller onkologi är meriterande. Kunskap om versionshanteringssystem (VCS) för kod (t.ex. git, snakemake, micromamba) är också en merit.
Villkor
Anställningen är på heltid och tillsvidare. Tillträde mars 2026 eller enligt överenskommelse.
Ansökan
Din ansökan ska registreras via e-rekryteringssystemet Varbi och vara inkommen senast
2025-12-09.
Ansökan ska innehålla:
Ett kort följebrev (ca en A4-sida) med beskrivning av den sökandes forskningserfarenhet, forskningsintresse och lämplighet för projektet.
Ett CV (Curriculum Vitae) som inkluderar examinas, teknisk expertis, anställningar, samt namn och kontaktinformation för 2 referenspersoner.
Publikationslista
Upplysningar
För ytterligare information, vänligen kontakta universitetslektor Silvia Remeseiro, MTB / WCMM, via
[email protected] (Institutionen för Medicinsk och translationell Biologi, Umeå universitet, 901 87 Umeå).
Mer information om gruppens forskning finns att läsa på våra webbsidor
https://www.umu.se/institutionen-for-medicinsk-och-translationell-biologi/
https://www.umu.se/en/research/groups/silvia-remeseiro/
www.umu.se/en/wallenberg-centre-for-molecular-medicine/
https://www.umu.se/en/staff/silvia-remeseiro/
Välkommen med din ansökan!
Umeå universitet vill erbjuda en jämställd och jämlik miljö där öppna samtal mellan människor med olika bakgrund och perspektiv lägger grunden för lärande, skaparkraft och utveckling. Vi välkomnar därför personer med olika bakgrunder och erfarenheter att söka den aktuella anställningen.
Till bemannings- och rekryteringsföretag och till dig som är försäljare: Vi undanber oss vänligen men bestämt direktkontakt med bemannings- och rekryteringsföretag samt försäljare av ytterligare jobbannonser.